Israel sijaitsee Lähi-idässä ja lännessä sitä ympäröi Välimeri ja idässä niin kutsuttu Great Syrian-African Rift Valley ja etelässä Punainen meri. Israelilla on rajat Libanonin, Syyrian, Jordanian ja Egyptin kanssa.
Pääosa Israelin väestöstä elää Israelin pohjois- ja keskiosassa. Tämä alue voidaan jakaa kolmeen pienempään pituusasteiseen sektoriin:
- Rannikkoalue lännessä, joka pitää sisällään Haifan ja Tel Avivin rannikkokaupungit.
- Jordanjoki soljuu idässä sijaitsevan pitkän laakson läpi ja liittää yhteen Genesaretin järven ja Kuolleen meren.
- Israelin keskiosassa sijaitsee vuoriketju, joka ulottuu Galilean, Samarian ja Juudean läpi. Täällä sijaitsee myös Jerusalem.
Koillisessa Israelissa sijaitsee Golanin kukkulat ja lumen peittämä Mount Hermon. Israelin eteläosassa sijaitsevat Negevin ja Aravan autiomaat. Korkeudet Israelin sisällä vaihtelevat 2224 metristä (Mount Hermon)–416 metriin Kuolleella merellä, mikä on matalin piste maan päällä.