Israel ligger i Midtøsten og omgis av Middelhavet i vest, Den syriske sprekkedal (the Great Syrian-African Rift Valley) i øst og Rødehavet i sør. Israel grenser til Libanon, Syria, Jordan og Egypt. Størstedelen av Israels befolkning lever i den nordre og midtre delen av landet. Dette området kan deles inn på langs i tre mindre områder:

- Kystsletteområdet i vest som inkluderer kystbyene Haifa og Tel Aviv.

- Det lavlendte dalføret i øst som preges av Jordanelva som flyter gjennom området og binder sammen Genesaretsjøen og Dødehavet.

- Fjellkjeden i midten av Israel som strekker seg gjennom Galilea, Samaria og Judea, og inkluderer området der Jerusalem ligger.

I det nordøstlige Israel ligger Golanhøydene og det snøkledde Hermon-fjellet. Den sørlige delen av Israel består av Negev-ørkenen og Arava-ørkenen. Høydene i Israel varierer mellom 2 224 meter (Hermon-fjellet) og –416 meter ved Dødehavet, som er det laveste punktet på jorden.