Israel ligger i Mellanöstern och omges i väster av Medelhavet, i öster av den s k Great Syrian-African Rift Valley och i söder av Röda Havet. Israel gränsar till Libanon, Syrien, Jordanien och Egypten. En majoritet av Israels befolkning lever i den norra och mellersta delen av Israel. Detta område kan delas in i tre mindre longitudinala sektorer:

• Kustslättsområdet i väster som inkluderar kuststäderna Haifa och Tel Aviv.
• Den låglänta dalgången i öster som präglas av Jordanfloden som flyter genom området och länkar samman sjön Galiléesjön och Döda Havet.
• Bergskedjan i centrala Israel som sträcker sig genom Galiléen, Samarien och Judéen samt inkluderar det område där Jerusalem ligger.

I nordöstra Israel ligger Golanhöjderna och det snöklädda Mount Hermon. Den södra regionen av Israel består av Negevöknen och Arava-öknen. Höjderna inom Israel varierar mellan 2 224 meter (Mount Hermon) och -416 meter vid Döda Havet vilket är den lägsta punkten på jorden.